針對政府組織，AEFP特別採用「即時透明加解密技術」，具備使用靈活、架構簡單與維護容易等特點，在不改變原有作業流程和使用習慣下，當按下「存檔」，AEFP便會將檔案自動加密，同時只要對檔案申請加解密、mail外發，以及開放授權攜出，AEFP便會自動記錄所有動作，以供未來稽查之用。

而這個加密檔案，在同一部門下可直接開啟瀏覽，如果像高灘地工程管理處和公路養護課，這兩個分屬不同單位，今天業務因素必須互通資料，就得經過管理者核准；需要mail到其它到合作廠商時，除了檔案加密之外，AEFP還會提供金鑰，兩者需同時具備才可以開啟檔案，內容也會出現浮水印圖檔，為防洩保護再多一層保障。

另外，AEFP也提供選擇不加密功能，讓特許職員儲存檔案時不直接加密，但為了未來稽核需要，以及保障部門權益，AEFP同樣會記錄所有動作，假設真的發生機密檔案外洩事件，也能依循記錄追踪。